המחלקה לישראל, באמצעות המועצה הציונית, מקיימת מידי שנה את הקונגרס הציוני לנוער. מדי שנה משתתפים בקונגרס מאות בני נוער מכל הארץ: נערים ונערות המהווים מרקם מייצג של המגזרים המרכיבים את הפסיפס האנושי הישראלי. המשתתפים בקונגרס זוכים ליומיים של חווית לימוד, סיור והכרות עם מקומות שונים בארץ ישראל, דנים בסוגיות עכשוויות בחברה הישראלית, מדברים ציונות ונהנים מהמפגש ביניהם.
