צירי הקונגרס הציוני בוחרים את הנהגת ההסתדרות הציונית העולמית, כולל חברי הוועד הפועל הציוני, וממלאים תפקיד משמעותי בקביעת בעלי התפקידים השונים במוסדות הלאומיים האחרים וגם יושבי ראש הוועדות, מנהלי מועצות שונות ומנהיגים קהילתיים שנבחרים למספר תפקידים שונים.
להלן רשימה חלקית של התפקידים הללו:
ההסתדרות הציונית העולמית
יו"ר ההנהלה הציונית
על יו"ר ההנהלה הציונית מוטלת האחריות הכוללת לפעילות השוטפת ולפיתוח ההסתדרות הציונית העולמית, לרבות גיבוש תכנית עבודה מתואמת שמיושמת באמצעות המחלקות והיחידות השונות שלה. כמו כן, הוא מעורב באופן פעיל בייזום פרויקטים חדשים, כך שהפעילות של ההסתדרות הציונית העולמית תוכל להשיג את יעדיה באופן יעיל, ובעידוד העלייה והחינוך לשפה העברית.
סגן יו"ר ההנהלה הציונית
סמכותו של סגן יו"ר ההנהלה הציונית היא בראש ובראשונה גיבוש התקציב של ההסתדרות הציונית העולמית ופיקוח על יישומו. תחומי פעילות נוספים שלו כוללים פיתוח של מוזיאון ומרכז הרצל, הסברה למען ישראל וחינוך ציוני, פיתוח אתר האינטרנט של ההסתדרות הציונית העולמית, פיתוח קמפוס חדש לארכיון הציוני ופרסומים.
ראש החטיבה להתיישבות
החטיבה להתיישבות של ההסתדרות הציונית העולמית פועלת בשיתוף פעולה עם ממשלת ישראל להקמת יישובים באזורים פריפריים של ישראל. פעילותה ממומנת באופן מלא מתקציבה של מדינת ישראל.
ראש המחלקה לפעילות בתפוצות
המחלקה לפעילות בתפוצות אחראית על חיזוק הזהות הציונית ומרכזיותה של מדינת ישראל בחיי העם היהודי. לשם כך, המחלקה מגייסת ומסמיכה פעילים ושותפים בפדרציות הציוניות בכל רחבי העולם.
ראש המחלקה לפעילות בישראל ולמאבק באנטישמיות
מחלקה זו נוסדה כדי לחזק את הזהות היהודית-ציונית בקרב הישראלים. כמו כן, הוטל עליה למצב את ההסתדרות הציונית העולמית בתור ארגון הגג הבינלאומי במאבק נגד אנטישמיות וגילויי שנאה נגד יהודים ומדינת ישראל.
ראש המרכז לשירותים רוחניים בתפוצות
ההסתדרות הציונית העולמית מטפחת מחויבות לציונות ולמרכזיותה של ישראל בחיים היהודיים בתפוצות, זאת על-ידי עבודה ישירה עם שלושת הזרמים המרכזיים ביהדות. הזרם האורתודוקסי פועל באמצעות המרכז לשירותים רוחניים בתפוצות, הזרם הקונסרבטיבי - באמצעות מסורתי עולמי, והזרם הרפורמי פועל באמצעות האיגוד העולמי ליהדות מתקדמת
יו"ר וחברי הוועד הפועל הציוני
הוועד הפועל הציוני הוא המוסד העליון בתנועה הציונית בתקופות שבין הקונגרסים. לוועד הפועל הציוני יש כל הסמכויות של הקונגרס, פרט לסמכויות ששמורות לקונגרס באופן מפורש. הוועד הפועל הציוני מפקח ובמידת הצורך מחליט על אופן היישום של החלטות הקונגרס והוועד על-ידי ההנהלה.
יו"ר האגף האמריקאי של ההסתדרות הציונית העולמית
האגף האמריקאי דואג לאינטרסים של ההסתדרות הציונית העולמית בארצות הברית.
יו"ר הנהלת הארכיון הציוני המרכזי
היעד העיקרי של הארכיון הוא איסוף מסמכים לצורך שימור, חשיפה והנגשה לציבור של חומרי הארכיון של התנועה הציונית. הארכיון הציוני המרכזי פועל כארכיון ההיסטורי של ההסתדרות הציונית העולמית, הסוכנות היהודית, הקרן הקיימת לישראל, המגבית המאוחדת לישראל והקונגרס היהודי העולמי.
נשיאות הקונגרס
נשיאות הקונגרס הציוני מפקחת על התנהלות הקונגרס. יש לנשיאות הקונגרס מספר זכויות מיוחדות, כמו הזכות להזמין אנשים או ארגונים הנחשבים כרצויים בקונגרס (ללא זכויות הצבעה או נאום). צירי הקונגרס הציוני בוחרים את הנשיאות במושב הפתיחה.
נשיא בית הדין הציוני העליון
נשיא בית הדין הציוני העליון נבחר על-ידי צירי הקונגרס הציוני העולמי. במושב הפתיחה של הקונגרס הוא מדווח על תוצאות הבחירות לקונגרס. נשיא הקונגרס הציוני העולמי גם אחראי על מינוי היו"ר וועדת הבחירות המרכזית, גוף המפקח על כך שכל הבחירות שמתקיימות בתפוצות נערכות על-פי עקרונות הדמוקרטיה.
מבקר ההסתדרות הציונית העולמית
מבקר ההסתדרות הציונית העולמית נבחר על-ידי צירי הקונגרס הציוני על סמך המלצות הוועדה המייעצת. דוח המבקר נמסר לידי הצירים של הקונגרס הציוני העולמי, והם מקבלים החלטות על סמך דוח זה.
פרקליט ההסתדרות הציונית העולמית
פרקליט ההסתדרות הציונית העולמית נבחר על-ידי צירי הקונגרס הציוני.
הקרן הקיימת לישראל
יו"ר הקרן הקיימת לישראל
יו"ר עמית של הקרן הקיימת לישראל
סגן יו"ר הקרן הקיימת לישראל
הסוכנות היהודית
יו"ר הסוכנות היהודית
סגן יו"ר הסוכנות היהודית
קרן היסוד
יו"ר קרן היסוד
